Keilmuan dan kesadaran untuk melaksanakan ibadah bagi seorang muslim sangatlah penting. Oleh karena itu, SMA Babussalam menyelenggarakan program yang berorientasi pada hal tersebut. Di antaranya shalat zuhur berjama’ah yang dirangkai dengan dzikir, ibadah shalat dhuha dan kultum, praktek manasik dan shalat jenazah, ziarah Study Wisata, hafalan doa harian, dan. Selain itu, peserta didik dibiasakan mengikuti kegiatan pembacaan shalawat, istighasah, Maulid, serta bershadaqah dan melaksanakan puasa sunnah.